淡水植物水族箱水温及水流对于水族箱的成败亦同样重要。

　　水族箱亦可就水温分为两种：热带及温带水族箱。大部分鱼类及植物只能生存于有限的水温范围。热带或温带水族箱较为常见，平均温度为摄氏25度(华氏78度)，而热带鱼是最受欢迎的水族生物。

　　温带水族箱的水温较热带水族箱为低，有一部分的鱼类较为适合栖息于较冷的环境。水的流动对于模拟天然生态系统亦为重要。水族人士会根据水族生物的需要，选择静止或有水流的水族箱。水温可用加热器(或冷却器，但较为少用)配合温度计以调节水温;水流则以潜水泵调节，或谨慎地设计水的内部流向(例如调整过滤器入水及出水位置)。